基因多重序列比对

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/11 17:09:41
基因多重序列比对

基因多重序列比对
基因多重序列比对

基因多重序列比对
多重序列比对(Multiple sequence alignment;MSA)是对三个以上的生物学序列(biological sequence),如蛋白质序列、DNA序列或RNA序列所作的序列比对.一般来说,是输入一组假定拥有演化关系的序列.从MSA的结果可推导出序列的同源性,而种系发生关系也可引导出这些序列共同的演化始祖.如右图般的视觉化叙述可描绘出各种突变事件,例如点突变的单格变化,或是如删除突变与插入突变,可使各个序列之间产生鸿沟.MSA常用来研究序列的保守(conservation),或是蛋白质结构域的三级结构与二级结构,甚至是个别的氨基酸或核苷酸.

是对三个以上基因序列所进行比对。一般来说,是输入一组假定拥有演化关系的序列。从多序列比对的结果可推导出序列的同源性,而种系发生关系也可引导出这些序列共同的演化始祖。

基因多重序列比对 怎样定义基因序列比对 怎样分析基因序列比对结果 如何使用DNAMAN软件进行多重序列比对 如何在NCBI中进行基因序列比对,比如小鼠p53基因与人类p53基因的比对 怎样进行基因组中基因功能相似的多条基因序列进行多序列比对? 克隆未知基因的序列,测序后BLAST进行了比对,是我们想要的序列,接下来对序列还要进行什么分析? 基因序列BLAST比对时,Max ident 低于90%,可以做进化分析吗? 动物dna序列为什么在ncbi上比对完和植物的该基因相似 经过同源比对得到一个基因的序列,我怎样才能知道该基因的保守区域呢? BLAST 蛋白比对求助请问测序结果和已公开序列的基因蛋白比对为99%,能否确定其为新基因还是未公开序列的基因中的某个?还需要做什么? 论文上说某个基因与某个基因的同源性达到百分之多少?同源性指两个基因的整个序列比对,得出的百分比吗? 如何使用DNAMAN软件将测序的序列翻译成氨基酸序列?怎么和已知的基因进行比对?麻烦具体点,非常感 怎样查找一种病毒蛋白所有不同亚型的基因序列?我想比对一下我这个蛋白的序列保守型, 已经知道基因序列,怎么知道它的Gene ontology?有没有这样的数据库,输入序列,它自己比对然后作GO注释? 有谁知道NCBI blast检测基因序列比对结果怎么看的吗?求懂的大神们指教 我最近在构建RNAi载体.在寻找目的基因cDNA与其他基因的非同源序列时,是与DNA比对,还是与cDNA?谢 断裂基因中的插入序列就是内含子,对不?