tm值与退火温度[求助]我想进行引物的特异性检验,进入primer-blast,怎么设置一些相关参数?我想进行引物的特异性检验,进入primer-blast,怎么设置一些参数?结果如何分析?直接在序列框中输入上空

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/05/05 19:44:38
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tm值与退火温度
[求助]我想进行引物的特异性检验,进入primer-blast,怎么设置一些相关参数?
我想进行引物的特异性检验,进入primer-blast,怎么设置一些参数?结果如何分析?直接在序列框中输入上空格分开下游引物blast的结果有其他的菌,但是分值低,有些是单条匹配,能说明特异性差么?

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我用primer 5设计出来的Tm值从来都是直接当退火温度用.用引物primer-blast的话我都是直接贴序列上去.有其他菌的匹配很正常,有些进化亲缘性很近的,只要在同一物种中没有匹配上的问题应该不大!

退火温度与引物的TM值的关系主要和DNA聚合酶与其buffer有关。
有些退火温度要比TM低5度、3度,有些还会高3度,有些是一模一样的。主要参考不同公司所生产的DNA聚合酶的说明书。

tm值与退火温度[求助]我想进行引物的特异性检验,进入primer-blast,怎么设置一些相关参数?我想进行引物的特异性检验,进入primer-blast,怎么设置一些参数?结果如何分析?直接在序列框中输入上空 关于退火温度与引物Tm~我用PP5做的引物发现引物Tm值比退火温度低 这很奇怪啊,做PCR是不是退火温度一定要比Tm高呢? 退火温度与引物的TM值有什么联系?为什么退火温度要比TM低5度左右最合适? 为什么做PCR设定引物退火温度时设定的退火温度要比合成引物得到的引物Tm值低几度? 求助巢式PCR退火温度的设定我最近准备做巢式PCR,下游引物用oligo dT,上游用两个基因特异性引物,但上游的两个引物和下游的oligo dT相比,Tm值差了将近10度,这样退火温度怎么设定呢? TAILPCR 反应体系中退火温度一般是多少 和特异引物的TM值有什么关系吗 如何进行引物退火温度的梯度设置 请教如何计算出兼并引物的退火温度我是一个新手,如何根据公司送来的兼并引物的单子上的Tm值推出实际PCR时的退火温度呢?引物单子上有两个Tm值,分别是1M 钠离子,50mM钠离子条件下的Tm值.实 引物的退火温度如何计算,用tm值减去5度,靠谱不?用1m na+的还是50mmna+? 我的引物设计有30个碱基,tm值分别为88和84,是不是太高了?那退火温度怎么设定啊? 设计的引物Tm值为50和55,退火温度应该在这个值上减5度还是减10度啊? 用primer 5.0 设计引物的时候,哪个才是真正的PCR产物退火温度Tm,看哪个? 带酶切位点的引物设计问题带酶切位点的引物设计时计算Tm值,退火温度及GC含量时是否要把酶切位点和保护碱基计算在内?我觉得不用,因为酶切位点可以不用跟模板结合, 引物的Tm值是什么 带酶切位点的引物设计时计算Tm值,退火温度及GC含量时是否要把酶切位点和保护碱基计算在内?我觉得不用,因为酶切位点可以不用跟模板结合, PCR过程中引物的碱基数量与种类 和 退火温度有什么关系?理由 退火温度低会对PCR产生什么影响?我做菌落PCR,使用一个特异性上游引物和一个T7下游通用引物,退火温度用的是较低的48度,但引物的Tm分别为57,71,阳性对照都没有出结果,请问是怎么回事呢?退火 pcr退火温度太高有什么缺点pcr的引物如果很长,导致tm值很高,这样扩增的退火温度就会很高,如达到65-70℃,会不会导致模板正反链的复性,从而导致扩增效率降低?