转录组测序结果拼接中得到的contigs和singletons,我想问下它们是什么意思,有什么区别.

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/28 17:58:29
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In shotgun DNA sequencing projects,a contig (from contiguous) is a set of overlapping DNA segments derived from a single genetic source.
a single gene or marker that identifies the comparable region in a target genome,but does not cluster with other genes or markers to form a segment is called a singleton.

转录组测序结果拼接中得到的contigs和singletons,我想问下它们是什么意思,有什么区别. 谁能告知下有木有关于基因测序拼接的原理的文章(中英都行)除了一二代测序原理,我还想知道那些什么contigs、scafford等是怎么拼接的,这是生物信息的内容吧,能介绍几篇文章吗? 从转录组测序结果中得到一基因预测的CDS,pcr后测序获得orf的后半段,怎么得到前半段?转录组测序给的貌似是完整的orf,全长1600bp左右,在该orf的两端设计引物pcr,产物直接拿去测序,结果orf的后半 为什么有DNA转录得到的mRNA中有内含子,而再从mRNA反转录(逆转录)得到的目的基因中没有内含子? 在转录组测序分析中,对于没有参考基因组信息的序列怎样进行注释,差异分析 此外,在转录组结果分析中,转录本有没有通俗一点的解释,或者,转录本有没有一个固定的含义还是说不同情况下含 做逆转录PCR,扩增出的条带怎样区分是残留基因组DNA还是反转录得到的cDNA得到的结果 转录组测序与转录表达谱测序的异同 转录组测序与基因组测序结果分析 Matlab中把两个向量拼接起来的函数是什么? PS中如何制作多边形图形的拼接?急 转录翻译过程中核糖体的作用? 生物学中转录的产物是什么 读到这样一句话:转录因子与启动子共转到细胞中.我想问,转录因子不是蛋白质吗,那么要把转录因子的基因序列克隆出来,连到表达载体上,转录因子的编码序列在哪得到,是启动子区,还是编码 DNAman能不能对测序得到的序列进行拼接呢?怎麼做? 提完RNA后,用TAKARA的反转录试剂盒做反转录,结果出现三条带,是怎么回事?如图所示, 是做基因克隆还是pcr产物直接测序?我从某植物转录组测序结果中找到一个基因序列,结果预测是有完整ORF的,但我在orf两侧设计引物pcr产物直接测序,多次测序的结果在orf两端的序列都不同,orf 你能通过剪切和拼接下列图形得到一个矩形嘛?在这些剪拼的过程中,剪下的图形是经过怎样的运动最后拼接在一起的?(1)平行四边形(2)梯形(3)三角形(4)四边形 8年数学上四边形你能通过剪切和拼接下列图形得到一个矩形吗?在这些剪拼的过程中,剪下的图形是经过怎样的运动最后拼接在一起的?(1)平行四边形(2)梯形(3)三角形(4)四边形